تم افتتاح أول فروع الأكاديمية في يوليو 2006 بفرع النادي الأهلي بمدينة نصر، وتضم الأكاديمية الآن 15 فرعاً على مستوى الجمهورية والدول العربية. فروع أكاديمية الأهلي القاهرة: النادي الأهلي بمدينة نصر. نادي «دايموند» بالقطامية. نادي حلوان العام. الجيزة: ملاعب مدرسة السعيدية الثانوية. النادي الأهلي بالشيخ زايد. السويس: نادي النصر للبترول. الدقهلية: استاد جامعة المنصورة. الإسكندرية: مدرسة فيكتوريا كوليدج. مدرسة بايونيرز. الشرقية: مركز شباب أبو كبير. أسيوط: استاد جامعة أسيوط. سوهاج: مدرسة سيتي. أسوان: استاد أسوان الرياضي. فرع دولة الإمارات. فرع دولة الكويت.
